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要清除苹果手机上的所有短信，可以按照以下步骤操作。
批量删除短信
1、打开手机“信息”应用。
2、点击右上角的“…”，选择“选择信息”。
3、在弹出的对话框中，可以选择想要删除的短信并勾选。
4、勾选完成后，点击右下角的“删除”按钮即可，如果想要一次性删除所有短信，可以选择对话框最上方的“全选”，然后再点击删除。
方法二：通过iTunes备份恢复并删除短信
1、使用USB数据线将手机连接到电脑上。
2、打开iTunes，等待软件识别并备份手机数据。
3、在iTunes中，选择设备图标，然后点击“恢复备份”，选择一个最近的备份进行恢复，这样手机数据将会被清空，需要注意的是，此方法会清除手机上的所有数据和设置，包括短信，恢复完成后需要重新设置手机。
方法三：通过第三方软件删除短信
市面上有很多第三方软件可以用来管理苹果手机上的短信，包括删除所有短信的功能，可以使用“QQ同步助手”等软件来删除所有短信，使用第三方软件时需要注意安全，确保软件来源可靠并谨慎操作。
无论使用哪种方法，都需要谨慎操作，避免误删重要数据，建议在操作前备份重要数据以防万一。